いつも参考にさせていただき、ありがとうございます。
是非、下記の内容についてご教示いただければと思います。

住宅を建てるために昨年11月に農業振興地域の除外申請を出し、現在、許可が下りるのを待っているところです。
土地は祖父の土地で、
祖父が住んでいる本家はその土地から50mほど離れた場所にあります。
先日、やっと審査が始まった旨の連絡がハウスメーカーからありました。
しかし、その時に市から「本家の家が建っている敷地の農地部分にコンクリート舗装したアプローチや駐車場があり、
これらを撤去しなければ除外申請中の土地も許可されない。」という通告がありました。
もちろん、祖父が宅地への転用申請を失念していたという落ち度があるのは十分に承知しておりますが、それによって私が住宅を建てようとしている土地の許可を下ろさないということが納得できません。
この自治体の対応は、法律や条例に則った適正な対応なのでしょうか。

以上、長文・乱文で恐縮ですが、
ご教示のほどお願いいたします。