契約約款による。。。としか言いようがありません。
工期延長の理由にもよるでしょう。約款に定めの無い事は、原則「誠意をもって話し合い」になります。

「請求できるか否か？」のお答えとしては、「どんな事でも請求はできますよね、、でも、その事と、払っていただける事は別ですよね」というお答えになります。

一般的に、請求してお金を頂戴する、、という方法よりは、その分、工事代金で相殺する、、というのが一般的ですし、先方も処理しやすい（受け入れやすい）ようです。