多分、あなた様のお宅で車庫ポーチのこの壁だけ、壁の両側が外気に接している部分ですね。だとすると、このような状態に至った経緯は想像できます。以下、私の想像が当たっているという前提で。。。

構造上は、少なくとも、この件に関しては全く問題は無いと思います。と、言いますか、むしろ、目には見えませんが、室内の外部に面する壁に関しては、全て同様の状態になっているかと思います。基礎幅が多分15ｃｍ、木造の壁の厚みが10.5ｃｍ（両方とも推測）で幅が異なるため、芯追いをずらしているのだと思います。つまり少なくとも「過失」では無く、このメーカーの標準仕様なのだと思います。

＞柱を真っ直ぐに見えるよう直す事は可能でしょうか。

正確な言い方をすると、基礎の方がずれている（更に正確に言うと「ずらしている」）ために起きる状態ですので、直すなら基礎でしょうね。メーカーさんのおっしゃる通り、基礎にモルタルを塗れば「見た目」は同じ幅になりますが、「色が変わって見える」「後で塗った部分にヒビが入るあるいははがれてくる」というリスクがあります。その点では、メーカーさんのおっしゃっていることに嘘はありません。後は木造部分を壊して作り直すしかありませんが、現実的ではありませんよね。

＞不可能な場合は賠償なり請求する事は可能でしょうか。

いつも申し上げるのは、「請求する」のはあなた様の意思ですから、答えは「請求出来ます」。金額もお好きにどうぞ。。。という事です。

ただ、ご質問が、「請求してお金が貰えるかどうか？」という事でしたら、私はまず無理と思います。構造的にも問題の無い事を、「見栄えが悪い」という理由で法的な行動（賠償請求）を起こすためには、「被害額の合理的な査定」をし、その妥当性を証明する義務はあなた様にあります。その為の費用と労力と精神力を考えると、とても割に合う行動とは思えません。

決してメーカーさんの肩を持つつもりはありません。私の客観的な見解のみ申し上げました。

大工さんが木を加工する時に、「墨付け」とか「墨出し」という事で、昔は木に墨で印をつけていましたよね。あれを「芯」と言って、加工のための基準線となります。
その芯をどのようにするか？を芯出しとか芯追いとか言います（現場用語です）

この芯の出し方は、施工会社によって、いろいろな考え方があり、どれが正解とかNGとかいう問題ではありません。あなた様のお宅に関して、ご不満のような状況にしない事も可能ではあるのですが、恐らく木材の加工がプレカット（工場加工）と思いますので、一人親方の大工さんのようには融通が利かないのも、仕方ありませんし、今まで、特にこの件で気にされるお客様も居なかったのだと思いますよ。

少なくとも、この部分に関して「欠陥」と呼ばれるような類ではなさそうですし、「ずれているね。確かにそうだよね。恰好がお気に召さないかもしれませんね。でも、弊社の仕様はこうなんです」と言われれば、「そうですか・・・」としか言いようがありません。

仔細、技術的な解説は、文言だけですと、悪戯に長くなりますので、省略させてください。