回答がつかないようなので。はっきり言って原因はわかりませんが、コーキングは黄ばみます。その期間は状況によってまちまちだと思います。考えられるのが油汚れの付着による促進。洗剤等などで清掃した際に洗剤にワックス効果のあるようなものは油汚れを付着させてしまうものもあるのでその付着による促進、くらいですか。。施工業者がわざわざコーキングの種類を使い分けてとか、何か不備のある作業をしたとは思えません。強いて言えばコーキングっていうのは少なからずこういった美観を損なう可能性を残すので、でっきるだけ細くします。

対応策としては黄ばんだものを落とすことはできませんので、コーキングを打ち変えるしかないと思います。今度は白ではなく、グレーとか色変わりの気にならない色にしてみては。