>?基礎モルタルに0.25?0.3mmのクラック(計３カ所)

基礎巾木の距離が長いほど収縮率が同じでも動きは大きくなるので、ひびの入る可能性をゼロにはできません。基礎本体まで入っているような深いひびなら心配ですが、もしそうなら表面のモルタルが浮いたり剥がれたりもすることがありますし、ほぼ表面上の仕上げのひび割れと思われます。

>?サイディングコーナー部分にひび割れ(計４カ所)

サイディングのコーナー材の製品不良かと想います。

>?まわりこ？といわれる幅木の隙間

廻り縁と言います。大工さんの腕もあるかもしれませんが、これも乾燥収縮で多少縮みます。

>?壁紙のジョイントコークがしわしわになってたりういていたり(各部屋なってます)

木造住宅の場合、避けられません。木が乾燥収縮、反りが出ることによってそこに貼ってある石膏ボードが動き、クロスが動くので、隙間やよじれが発生します。３年くらいまではよく出ます。５年以上経つと少なくなります。おそらく１年か２年までは保証して直してくれるのでは。

>?ドアに沿って壁紙やジョイントコークが割れている

上記と同じ。

>あとは引き戸の隙間が上と下では開き具合が違います。

引き戸の下、前後に戸車がついており高さ調整することによって傾きを調整できます。調整できるように作られてるためそこが逆に動いて傾いたりします。調整方法を教えてもらいましょう。

>壁に顔を付けて引き戸の枠を見ると、上が反っている？曲がっている？ように見えます…

クロスの壁の面よりも枠が飛び出しているのを「チリ」と言います。例えばチリを１ミリしかとらないと、こうやって歪みが発生した場合目立ってしまいます。ここを大きく取ると目立ちません。そういう建築の知恵ですが、チリは少ないのかも。人が作るものですから、必ずしもすべてがまっすぐ！水平！９０度！な訳ではありません。

よって何も心配される部分はなくごくごく普通な状態に見えます。誠実な工務店さんですからその度に心配な点は相談して対応してもらいましょう。家を建ててからその後何も変化のない家などありません。そうやって家に興味を持ってこまめに修繕をしていくことで家は長持ちすると思います。

サイディングの正規品ですが、大昔は同質出隅はオプションでコーナーのみ無柄の出隅材を使うことが多く、同質出隅は高価でした。そこで正規サイディングのたん板を購入してそれをkっとしてくっつける業者が現れ、ローコスト化が図られました。今ではそっちが主流なんじゃないですかね。はじめは粗悪品もありましたが、最近はあまり聞きません。たまたまだと思いますよ。