こんな事はあってはならないのですが、
長い間建築業をやっていると、基礎を180度間違って作ったり
上棟時に玄関の向きが違うと施主様より指摘されたり、
建物が仕上がってから、実は違う土地に建築していたと
本当に？と思われるような事例があります。
私は経験していませんが、ハウスメーカーの仕事で普通にありえていました。
今の時代にはこのような事例は少ないですが、すべて建て替え若しくは
基礎をやり直しというお互い最悪の結果になりました。

本件をあ?だこうだ言うても、どうにもならないので大変気の毒だと
思います。
駐車場が50センチ小さくなったおかげでギリギリになったとの事で
非常に大きい50センチです。
駐車場の50センチ小さい所に入れてみられれば、ショックを受けられると思います。

金額に関しては、なんとも言えませんが、私なら建て替えを希望しますね。
一生後悔すると思います。
ビルダーとこれからも末永く関係をしていかなければならない為、
上記のような事になると、きっと立て直しても良い家にはならないですし、
関係も悪化するでしょう。
大手ハウスメーカーではあれば、そんな事を気にせず建て替えを伝えてくるでしょうが、中規模との事ですので、非常に難しい問題です。

最終はあなた様が　どんな気持ちなのかが重要です。ありえない憤慨なのか、
仕方無いなぁ、早く住みたいし等あると思います。

いろいろな人に相談すればするほど、いろんな意見が出てきて
ややこしくなります。
お金を減額してもらえれば、納得するのであれば、
それが100万なのか400万なのかもあなた次第です。

相手の出方を見て考えるのも手かもしれませんね。

友人の弁護士に尋ねてみましたら，以下の様な回答でした。
まず，建て替えは無理ということです。
法律的な考え方としては，できるだけ無駄なことは無くしましょうということだそうです。
建主のお気持ちとしては納得いかないかもしれませんが，法的にはそういうことになるそうです。
しかし，基礎の位置の間違いによって生じた損害分を請求できるということでした。
具体的には，例えば位置の間違いにより，自宅に駐車できなくなり，近くの有料駐車場を借りなければならなくなった場合にはその駐車場の料金を請求できるということでした。
どれくらいの期間の分が請求できるかは話し合いの上ということです。
今回のケースについても，そのような具体的な損害分を計算の根拠にして話し合うことになると思います。
慰謝料云々については，皆さんのおっしゃるとおり弁護士さんの出番となりますね。

質問者様は

>業者に何処までを要求できるか、妥当な落としどころを教えて下さい。もうお金しかないような気はしますが…いくらぐらいが妥当な金額なのでしょうか？

とおっしゃっています。

建て替えなんて無理とおっしゃっていますが、こちらから要求して
相手がYESと言わすのは無理だと思います。裁判でも多分無理でしょう。

ただ弁護士とか私は専門外ですが、弁護士に頼むとお金がかかり
請求根拠を明確にした数字であれば、
相手からもらえる確率が高いと言うものであると思います。
駐車場の金額とか、車を買い替える費用等明確にするため
相手に金額の根拠が伝わります。
多分こんなのは雀の涙程度に終わると思います。


上記の質問を回答すると、質問者様が　100万で良いと思っているのか、
400万なのかが重要で、私が工務店側であれば地鎮祭の時指摘されているにも
関わらず、当社のミスでこのような事案になった場合、建て替えを請求されても
仕方ない事案と思います。しかし、対抗すべき事案に発展し
弁護士に相談し裁判になると思います。
裁判費用その他経費時間等が相当ロスするため
示談交渉になります。それで最悪建て替え、建築主が400万で
手を打つと言われれば、私なら400万支払います。
悪評も建ちますし、良いことはありません。
曳家という案もありますが、建物も歪みますし、クロス等貼替えをしていれば
こだわったお家との事なので元通り新築にはなりませんし、相当な金額がかかります。地盤改良や、杭打ちが伴っていれば　家をどこに移動する等の問題が発生してきます。

その費用を質問者様も　お金しかないようなとおっしゃられているので
相談としての回答を差し上げた次第です。
質問者様が求めている回答をする方が良いと思います。

ただ　大手ハウスメーカーは　高額なお金を提示したり、建て替えと
簡単に提示します。
それは、悪評やどんな修理提案をしても結局建て替えに相当する金額が
かかってしまうケースがあるからです。私は大手ハウスメーカーで現場監督していましたので違う担当者でこの手の事案を何件もみています。
建物の原価なんて意外と安いのです。
同じ物を再建築するので経費も相当安くなります。

今回重要な点は、地鎮祭の時に指摘したが直っていないという
過失。
それを再度確認しなかっった質問者にも落ち度があります。
裁判になれば、負ける若しくはこれだけしかもらえないの？と驚く金額と
思います。建築の裁判なんて相当難しいのが実情です。

ただ　裁判になれば、お互い負担が増します。
ですので示談で済まそうというのが相手の案と思います。


最後に　一方的に建て替え！と怒り口調で言えば、どうぞ裁判でも
して下さい。と捨て台詞で帰られる可能性もあるので
（その後の関係も悪化）おだやかに相手の出方を待ちつつ
こちらの要望を要求しても良いのではないでしょうか？

再度,弁護士に話を聞いてみました。
質問者様の意に沿う回答にはならないかもしれませんが,法的にはかなり厳しい状況ということです。
それで,建築業者の良識,善意に訴えて話し会うしか方法が無いようですね。
その結果,お詫び金が増額されれば良しということでしょうか。
仮に,話が決裂して法的に扱うとなると,質問者様としてはかなり不利になると言うことですから,その点を踏まえて交渉されるのが最善かと思います。
金額的なことについては,物損についての慰謝料は原則,認められていないということでした。
一例を上げますと,買ったばかりの新車を一方的に追突されて,修理はしたものの完全に元には戻らない場合,車についての慰謝料は認められないということです。
庶民感覚としては何だかなぁとも感じますが,法的にはそうなるということでした。
それで,なるべく穏便に話を進めて実利を得るようになさるのが得策かと思います。
あと,各地元の弁護士会で,30分5000円で建築専門の弁護士が相談に乗ってくれる制度があるということですので,それを利用されるのも良いかもしれません。