正直なところ、「？？？？」なのです。
「悩み沢山」さんではなく、業者に対して。

　実際、一度も現場に立ち会わないような、お客様は、いらっしゃいます。
が、自分の家の間取りなり、仕様なりを一切　知らないで、いいはずはありません。と思います。

　まず、「素人」扱いをしていたにしても、「間取り」くらいは、相談があって、しかるべき。
　設計図の「詳しいことは、わからないだろう！」扱いをしていたにしても、図面を見せて、簡単な説明ぐらいはあってしかるべき。
　それに、間に合う、合わない。ではなく、工期を示して、いつ頃「基礎」
いつ頃まで、大工さんがいて、いつ頃、完成。とか、知らせるのが、当たり前。

いちばんわからないのは、

　「予算的にお客様様の設計図を作る予算が取れなかったので、お渡しする事が出来ません」と言ってきます

では、図面もなく、家を建てているわけ？
「確認申請」なし？それでも、平面図くらいは、無いと・・・・・
大工さんは、手板もなく「墨付け、切り込み」できるわけ無いじゃん。

正直なところ、「？」が連続発生してるのですが？

家の受注契約には、図面、仕様書、見積書、工程表などの全てが契約書としてみなします。
本件においては確認申請書が出されているのですから、少なくとも、間取り、配置図、立面図、構造図（かなばかり図）、それに仕様書が添付されなければ役所から受理されません。

つまりそれらの書式は整っている事になり、これを建主さんが契約時に受け取っている事が常識です。
工程表が無ければ、いつ完成していつ入金できるかもわかりません。
つまりこれらの書式は、予算の有無に関わらず請負者、建主さん双方に不可欠なものです。

家づくりは建築する工務店と建主さんとの信頼関係が最も重要です。
出来あがって住んでからのメンテナンスは、延々に続くのですから施工者との意思の疎通や信頼回復を早急に行う工夫をすべきです。
ハード的な疑問にお答えするのは、この住宅110番でもお力になれますが、施工者と施主との人間関係まで言及する事は困難なものです。

「地番調査」と「地盤調査」は全く意味合いが異なります。
敷地の登記上の「地番調査」の結果は、引き渡し時でも問題はありあせん。
地盤の地耐力を調査した「地盤調査」なら、その結果に基づいて構造設計や見積書が出来ますから、建主さんが見ていて然るべきものです。

いずれにしても信頼して家づくりが完工し、安心して住める家は、施工者と施主さんが協力しあえる共同作業が基本となります。
質問者から積極的に施工者にアプローチして信頼関係を取り戻し、良い家づくりを実践してください。