初めまして、お世話になります。

当方一年ほど前より店舗併用住居を計画して、最寄りの工務店などの中から予算に合うところを探しておりました。
知人に紹介を受け総合的に建設業をやっているという会社と話をしたところ、これまでの建設会社の出してきた見積書よりも安くできる等の事もあり、希望する完成の時期を3ヶ月先延ばしにしてでも数百万の建築費用が安くなるならばと思いそちらと話を進める事にしました。が、とんでもなく何事にもルーズで電話をかけてもまず出ない、出られなかったのであれば社会人としてコールバックは必須だと思っていたが、それすら無し。
ならばメールなら時間を選んで見てもらえると思い送っても返信もなければ何のアクションも無し…
その時点で辞めておけばよかったのかもしれませんが、商売を長く休むわけにもいかず、そこからまた違う建築会社を探すよりは紹介された建設会社とうまく付き合うほかないと判断し、かなりスローなやり取りで設計や予算の話を詰めていき、数ヶ月前に正式契約をして現地での作業をしてもらい始めました。
当初の契約書には6月末日の引渡しを明記しているのにも関わらず、工事が始まるや否や2週間ほど工期が延びそうですと言い始め、此方としては6月末でも完成時期に対しかなり譲歩しているのに先方は正当性を主張し当たり前のように工期の延長をほのめかして来ています。
その他にも、此方の都合で多少のオプションが追加になったりで本来の見積書には無い費用がかかるのは仕方がありませんが、当初の見積書の内容がゴチャゴチャになって来ているので見積書の改訂版を出して欲しいとお願いしたところ、目を疑うような内容の改訂版の見積書を出して来ました。
具体的には、此方としては話の流れの中で見積額が極端に変わるような内容変更をしていないのに項目が増やされ新たな費用を算出されたり、これまでの見積額が倍近い金額になっていたりする項目があったりという点に不信感を持ちます。
この建設会社とは請負契約を結んでいるので、当初の契約時の見積書が有効になり相手方の見落としや見当違いについて此方が請求を起こされるものでは無いと考えていますが間違っていますか？
契約書の内容の中で遅延についても、年10%を日額として遅延した日数分の約束になっていますが、それ以外に商売に対する保証をする事は示されていませんが、工程管理不足による遅延は契約書に無くても請求権のような物は発生しないのでしょうか？
説明不足も多々ある内容かもしれませんが、専門家の皆さまのご意見をお伺いさせて頂きたいので、どうぞ宜しくお願い致します。