あくまでも写真でしか判断できないのが、もどかしいのですが、

>これは大丈夫ですか？

　何をもって、大丈夫とするか？ですが、
見えている「水」そのものは、幸か不幸か内部にいっていないわけで、かろうじてOKでしょうか。
　その出ている穴、およびその穴の奥、水がどこをどう通って、ここに至ったか？
それは、調査次第ですが、NG要素が強いと思います。
　まず、サッシの溝(建具が走る部分）の部分の水が、ここに多量に集まって流れた。・・・・のであれば、
　この穴の奥にそのための穴がさらにある事になります。その穴から、すべて表面に出てきている。のならば問題は少ないと思いますが、いくらかがサイディング裏に入っている。のならば、その量により、対策が必要です。
　多少のことは、サイディング裏には「通気層」があり、そこを流れて、土台水切りのところに出てきます。直接室内には入っては行きません。
　それも、量の話で、多ければ、さばききれないし、サイディング裏を痛めます。

　この水が、どこからかサイディング裏に入り、ここで表に出てきた。とすれば、
ここだけを見て、対策は不可能でしょう。ましてや、この量の水が、だとすればです。　ここで穴をふさぐ・・・考えよりも最優先は、入るところを特定して、それをふさぐ、直すことでしょう。

　そうとは特定しませんが、二階サッシのさらに上、外壁、屋根、壁の付属物、その他から入った水が、二階サッシの「上枠」上側にたまり、それが横に流れ、横枠を伝って、下に流れ、穴が有った部分から表へ。と、推測もできます。
　ただ、今写真で見えるこの量の水が、・・・・と考えると、大ごとに感じるのは、私だけでしょうか？

>本当に大丈夫ですか？壁の中

　通気層が有る前提での話であれば、直接　室内とは水の行き来はないと思いますが、この量が心配です。壁の中が、外壁材(サイディング）の裏　ということであれば、NGです。
　原因を特定し、早急の修繕をすべきと考えます。