6センチとは 結構大きいですが
定規を当てた写真 投稿できますか？

陥没という表現はどうかわかりませんが
自然石は 工業製品では無く
無垢の木のような味わいがあります。
二枚程度 よっぽど気に入らないのであれば
張り替えてくれるでしょう。

　写真をお送りいただくことはできませんか？
　写真といえども、真実を写しているわけではありませんが、
客観的に判断するには、必要かと思います。

　自然石とか、無垢の木材とか、お使いになりますが、
まるで、「工場製品」の「高級品」のような幻想を抱いている？のでしょうか。
ある意味、高級品ではありますが、決して工場生産品ではありません。
そこの「味」を購入するものではありませんか？
　もちろん、工場生産ではない　ということには、施工時の技能の差も、出るし、出てもそこが味・・・の可能性もあるということです。(そこの客観性を言うために「写真が見たい」と言うことです）

　もう一つ、
　確かに、「張り直し、貼り直し」は、できるでしょう。
キット、「どうしても、気にくわない」とすればです。
　ここで、施工法や下地の状態によりますが、必ずしもなんの問題も無く終わるとは限らない。ということが発生します。
多かれ少なかれ、傷を付け、破壊して、「撤去」し、そこに後付けで「張る、貼る」施工をするわけです。
　「一体化」しているはずのものを、切り離して別体の物として繋ぐ・・・わけですね。
決して良いこととは、言えない要素を否定できません。

　いずれにしても、もう少し客観的な目で見るためにも、写真をお願いしたいところです。

基本的にプロなら自然素材だよ、そういうもんだよっていう言い方は極力避けて、納得いくような説明をすべき。

> 石の所々に割れ目のようなヒビが入っていたり、ひとつの乱型石のなかで欠けが生じており

石の乱張りを施工しているところを見ていただろうか。原則としてまず、石の割り付けを行う。石をどんな配置で張るのか実際に並べてみる。その際にできるだけ自然に隙間の少ないように、既存の石を選んで並べていくわけだが、時には小さな隙間などは石をたたき割って小さくしたものを入れたりする。その際に叩き割ったものを目地を入れずに張ってしまっている状態なのかなと思った。もしそうだったら施工としてはちょっと悪い施工。張った後に割れることはまずない。その場合は中に空洞があるってことだからあまり良い施工ではない。
→逐一、指摘をして張替えなどの対処をしてもらいたいが、全く同じ形の石はないので、余計に目地が大きくなってしまうかもしれない。

> 部分的に剥離されているような状態

これはありうる話で、石の種類によっては積層上にはがれるものは多い。ただ、そう簡単にはがれるもんじゃないので、基本的には張るときの選別の問題だと思う。張った後にうえから共材を張るなんていうやり方は普通はしない。

> 目地幅が3?6センチと全体的に広く不均等だったり

目地自体がみな3センチ以上で、大きいところで6センチだとしたらちょっと目地が大きめだね。大きいところで、3センチとか6センチのところがあるよっていうのだったら場合によってはありうると思う。目地のはかり方にもよるし。何枚かの石が集まったような交差点の部分だったら6センチ…ちょっと大きめだけどありうるのでは。これは職人さんのセンスと腕にかかっている。目地幅が「不均等」っていうのは割り付けの時点でできる限りまっすぐになるように割り付けるが、そうではない部分も多少は出るでしょう。っていう程度だと思う。完全に一対一の石の目地が斜めで大きいのは下手ってことだね。

基本的にどんな状況だろうが、ある一定のレベルで張り直しを強要できるような法律や決まりはないし、その業者がこれが普通ですといえばそれまでだから、うまく交渉をする必要がある。その職人の技量もあるし、できないといわれれば任命責任じゃないけど、その業者選択の限界なんだろう。写真を見てもこれもまた見る人の技量によって、普通か上手いか、下手が分かれてしまうし、すべての工事で日本一の職人が施工をするわけではないので、今の相手、条件の中でうまく交渉をしていくのが良いと思う。そのために上記のような経験・知識が必要っていうこと。

　写真を見せていただきました。
あくまでも、「私感」です。
　全景の写真がほしい気がします。が、
見えるところが、一番「気になる部分」とすると、自然石を使用して・・・であれば、
客間的に。。。こんな感じでも良いのかな？と思いますし、直し始めると「傷」の方が大きいかな？と思うのですが。