鉄筋などが所定（設計）通りという前提、それと、多分、枠のジョイントで外れたのだと思いますから、コンクリートの厚さは結果として設計以上になっているという前提で、、、

構造耐力上は何の問題も無いと思います。

後は、美観上の問題（みっともない）でしょうか？

どんな方法にせよ、やり直すために、部分的に壊したりするのは、技術的には最も愚策、補修と言っても、薄いものは後塗りすればいいのですが、厚いものは何らかの方法で壊すしかないので、感心はしません。技術的には今より悪くなるだけです。

よくあるお話で、全て壊してやり直し、、などと言う要求をするのは、基本的な性能に問題が無いので、少々過剰過ぎる要求でしょうね。そんなお話を持ち出した時点で、紛糾する事が容易に想像できますので、あなた様にとっては得策で無いと思いますよ。

あまり必要以上に責めると、「納得してもらう」だけのために、むしろ技術的には愚策と思われる方法を、工務店が選択する可能性があります。技術的には、そっちの方が嫌ですね。。

ある意味、ご期待に添えない答えなのかもしれませんが、技術的観点からは、こうなってしまいます。

この事による、被害額みたいなものも、算出しにくい（あるのは、あなた様の心情的な部分だけかと思います）ので、妥当な値引き額というのも、如何とも言い難いです。

取りあえず、許容した上で今回は「貸しにしておくから、これからはちゃんとしてね」というあたりが、賢い落としどころかと思います。

人間の行う事ですから、間違いはあり得ます。また、基礎に関しては、工事の一番最初の部分で、施主も神経質になってらっしゃいますので、必要以上に過敏に反応する方も、こちらの相談コーナーには多々いらっしゃいます。

みじんこさんが、冷静に受け止められていらっしゃる事、敬服いたします。

また、施工者側も、何かと誤魔化そうとする輩が多い中で、ミスはミスとして認めるというのは、ある程度のペナルティを受ける覚悟があるという事で、勇気と誠意ある行為と感心しました。

無論、間違いは「0」である事が最終目標です。これを機会に、信頼関係を熟成して、いい家づくりをしてください。