頂いた図だけの判断だと、私の判断は△です。

〇か×の判断ではなく、不安があるようでしたら、施工者（または設計者）に
「不安なので補強してくれ」と依頼し対応して頂いては如何ですか？

技術的には様々な補強方法があると思いますので。

おそらくCADで描かれたであろう、立派な図面なので、それなりの知識をお持ちと推察し、少々専門用語を使います。

・（二）いわゆる2倍相当　の金物であるという事なのですが、そもそも、どのような計算に基づいているのか（N値法or許容応力度計算）不明
・よって、その部位にどの程度の引き抜きを負担させているのか不明
・仮に部分欠損によって許容耐力が低減されていても、上記の計算により余力範囲内であれば〇
・さらに建物全体の応力分担を俯瞰しての判断が必要で、仮にこの程度のお話であれば、おそらく何の問題も無く、〇
・上記はあくまでも「推察」であり、この絵からは、そもそも全く工学的判断が出来ないので、そういった意味では「？」

・ホールダウン金物が「ラグスクリュー」っぽい絵になっていますが、もしやすると、「アンカーボルト」ではないのか？という疑問
・だとすると、土台欠損は、ほぼ何も影響しないので「〇」

・とはいうものの、あなた様が「疑念」を抱いた時点で、工務店の顧客対応としては「×」

以上を勘案して「△」とお答えしました。

＞なぜ×ではなく△なのでしょうか？

もしやすると「×」という答えを期待されていたのかもしれませんが、仮に私が工学的判断で「×」と思ったとしても、匿名のあなた様に、そのような断定的なお答えは出来ません。その事をもって、工務店さんとの関係が妙にこじれるのは、私の本意ではないからです。

健康相談で、「お腹が痛いのですが」「それは胃がんです」と答える馬鹿な医者はいないでしょう。。

補強方法も、「工学的」には色々とありますが、それは力学的な裏付けをもって、決めなければならず、おそらく、今回は、「工学的には安全」で「何も処置しなくても大丈夫」だとしても「あなた様の心理的不安」への対応が必要で、それは、やはり、工務店さんとの話し合いの中で、あなた様が納得する方法でなければなりません。

確認申請上の「設計者」若しくは「監理者」に、素直に「不安感」をお伝えいただき、あなた様の納得する方法で対応してもらうのが最善と思います。

私であれば、欠損部にエポキシ樹脂を注入するか、可能であれば、追加で引き抜きPLを打ち付ける程度かと思います（あくまでも念のために、、、という意味で）

その金物が実際に有効か無効かを論議するより、仮に無効であれば、、、という前提で、補強の方法をお考えになる方がいいのではないでしょうか。

いかようにも方法はあると思います。

再掲

私であれば、欠損部にエポキシ樹脂を注入するか、可能であれば、追加で引き抜きPLを打ち付ける程度かと思います（あくまでも念のために、、、という意味で）

竣工しているのであれば、外壁を一部、解体しなければ工事は難しいのかな？と思います。

あとは、そこまでして行うほどのリスクなのか、そこまでせずとも、無視していいレベルのリスクなのかの判断で、そのジャッジは、何度も申し上げますが、論理的な工学的判断ではなく、おそらくあなた様の心持ち、、主観的、心情的な判断になろうかと思いますので、私には判断つきかねます。