木造2階建て住宅の新築の設計・監理・施工をある工務店と契約し、現在工事中の者です。

昨日、工事現場を見に行くと基礎が打ち終わっていました。
ホールダウン金物が重要なものであることを知っていたため、
念のため図面を片手に間違いない位置に入っているか確認しました。
そして15kN用のホールダウン金物が一ヶ所あることに気付き、
担当に確認したところ、施工漏れであるため対応を検討するとの回答がありました。
また、構造検討しなおしても、それは省略できるものではなく、必要なものだそうです。

このような事態について、適切な対応方法とはどのようなものがあるでしょうか。
調べると、ホールダウン金物を必要としない引抜金物で代替する、あと施工アンカーでホールダウン金物を取付ける、基礎を部分的に破壊してやり直す、といった方法が見つかりました。

もしかしたら技術的には支障ないのかもしれませんが、高い工事費を払う側としては、新築にもかかわらず傷物にされたようで腑に落ちません。
また、品質が低下するのではないか、法的(建築基準法、長期優良住宅の基準)に認められていることなのか、
といったことについても、いまいちはっきりとわかりません。

正直、技術的には問題なければまぁいいか、という気持ちもある反面、
法的にNGならば、万が一の際に誰の責任になるのか、地震保険はおりるのか、そしてやはり"新築"という思いも強いです。
なお、まだ着工したばかりなのに、これが最初のミスではないことも我々家族の心配を大きくさせています。
このような事態について、何かアドバイスをいただけないでしょうか。

また、ホールダウンの施工漏れというミスは、業者としてはどの程度まずいミスなのでしょうか。
重要な部位であるにもかかわらず、リカバリーも難しそうなので、
自分が担当なら最もやってはいけないミスに位置づけられそうな気がします。
現場ではよくあることで、簡単に謝って済むような話でしょうか。
参考にご意見を頂戴できれば幸いです。

どうぞよろしくお願いいたします。