窓の角から斜めに入るクラックは全体の構造の安全にさして影響ありませんし、打継からの漏水は、言い方に語弊あるかもしれませんが、まぁ、、これも「安全性」には問題無いとして

＞建物の内外から一目でわかる一周のひび割れが2か所
＞楯のひび割れも10か所以上、いずれも巾１ｍｍ以上

この字ズラだけ拝読すると、構造に少々難があるのかな？とも思います。

設計・監理・施工　が一緒の会社だったりすると、悪意の無い「間違い」がノーチェックのまま出来上がったりします。

実際に瑕疵として補償を得るには、ハードルは相当に高いと思いますが、
RCの建物を相当数手掛けている設計事務所さんなんかに、ちょっと、設計図と現場を見ていただいた方が安心かもしれません。