>昨年建てた家のインナーガレージの壁側に30cmくらいの水たまりを発見しました。

山本様も気にされていますが、
　道路とガレージの高さ関係はどうなってますでしょうか？
道路より、ガレージ入り口の高さが高い、低い・・・・
　つぎに、地盤とガレージ床の高さは？
ガレージ床より周辺の地盤が高い、低い・・・・
　ガレージ床の高さは、入り口部分と、奥まった部分とで、どのくらいの差？
水がかろうじて流れる。見るからに置くが高い。などなど・・・
　ガレージ床より建物の床高が高いと思いますが、どのくらいの差でしょうか？
　ガレージ壁の下側（基礎）部分と壁上側の壁の種類は？
基礎部分は、コンクリートでモルタル仕上げ、上側は、木造壁とか・・・
上から下までコンクリート、あるいはモルタル仕上げとか・・・
とりあえず、全体の写真と、問題の部分のアップ写真があると、判断しやすいかもしれません。

>物を置いたりできないし、湿気対策なのに水たまりというのはなんとも納得できませんので

詳細は上の回答をいただいてのことと思いますが、
物を置く部分には、「すのこ」を敷くことをおすすめします。
湿気は他から影響されなくとも、ガレージ床の土間コンクリート自体の湿気が影響します。段ボール箱を直接置くとどうなるか？わかりますよね？
原因はともかく、すのこで　さしあたり影響を減らせると思いますが？

>基礎と建物に湿気対策で隙間があるため、台風のような強い風雨の日にはどうしても入る

文章のみからの推測になっちゃいますが、基礎の通気パッキンや通気口から風雨で入るという意味だとしたら、基本的にはビルトインガレージは通気しなくても良いと思うのですが。換気という意味なら窓や換気扇を付ければ良いことですし、その辺の工法的な部分を確認してみては。

それからガレージ床の水勾配が甘かったのかなと。広さによっては結構悩みます。1／100程度ですと職人さんによっては水たまりになることがあるかも。ただあまり勾配をつけると高さが納まらないところがでてきます。ただはじめから雨や水が発生しないところなら勾配はさほどいりません。後者のように考えていたが入ってしまった可能性も。勾配を幾つにしているのか？なっているのか？も確認してみては。

>これはそういうものなのでしょうか？

不便を感じているのであれば改善の余地はあるでしょう。
勾配を上塗りして取り直すくらいしか思いつきませんが。