申し訳ありません。いまいち、状況がつかめないのです。
擁壁上に積むブロックが1段。
これは、単純に載せるだけ。ではなければ、問題無いと思います。
あとは、それの固定の方法を相談して確実なものを決定すれば良いとおもいます。
砂利の上に2?3センチ。
土留め(砂利止め）としてのブロックでしょうか？通常のブロックは20ｃｍほどの高さがあるはずですので、残りの分が片面からの土圧を受けるとすると、固定に気を使う必要があります。
両面で土圧を受け、その差が2?3cmであれば、そう 気にしなくとも良いのですが。
砂利上からの2?3ｃｍという段差の件であれば、使用する用途による・・・という回答でしょうか？人が歩く・・というのと、車が通る・・・、単に用途上の見切りとする。ということでは、違うと思います。