基本的には取締られ役平社員さんのご指摘のように、室内が負圧であるために、何処かから臭気を吸い込んでしまうものと考えられます。

「床下から糞尿や、たばこ等のにおいが上がってきて」とありますが、臭気の強い部屋は確認されていますか？
KIKOさんの臭気の対する敏感度は不明ですが、糞尿の臭気が「とても臭い」ということは異常です。

糞尿臭気については以下の原因が考えられます。
１．排水口のトラップの封水切れ（トラップ内の水がなくなること）
・・・・ありえないことではありますが、臭気はトラップのある器具の近くで発生しますので、臭気原はつかみやすいです。この場合は原因についてはご相談ください。

２．排水管から床下（スラブ上）に漏水があり、そこにたまった排水が臭気を発生。
・・・・1日数回ということですから、トイレなど排水を流すたびに、漏水（多分少量）
が溜まった排水を動かして、臭気を発生させるのかもしれません。

３．通気弁の故障
・・・・KIKOさん宅は最上階ではありませんか？
排水管の共用竪管は屋上に立上げて通気管を取付けますが、まれに竪管頂部に（最上階）に通気弁を設置することがあります。
この場合、この弁の故障で通気弁から排水管内の臭気が漏洩し、室内に流れたことも考えられます。この場合も衛生器具の使用時（階下のものも含む）に、臭気がKIKOさん宅に押し出されることがあります。

煙草の臭気については、床下から上がってくるのですか？
竣工図面を見なければ何とも言えませんが、隣の家の排気が、外からKIKOさん宅の吸込み口に吸い込まれるパターンが一般的です。
火災報知設備がある場合に、この電線管経由で、隣または下の階の住戸の煙草臭気が、過煙感知器で感じられたケースはありますが、床下からではありませんね。

しいて言えば、極めてレアケースですが、工事中にスラブに何らかの孔が開いていて、ふさぎ忘れたため、KIKOさん宅の排気設備により、下の部屋の煙草の臭気引っ張られてきた可能性もあります。　

管理会社に連絡し、デベロッパーに対処させてください。
瑕疵期間は過ぎていますが、アフターサービスの範囲内と思われます。