>こちらとしては穴の開く前の状態にもどして頂きたいんですが、この場合今言われている修復方法で了承するしかないのでしょうか？

お気持ちは、もっとも　なのですが、不可能と、考えるのが妥当でしょう。
築何年のものか？不明ですが、
過去、サイディングの厚さは、大変革がありました。12mm製品が無くなりました。
製造そのものが無いのです。（一部、未塗装品、特注品などを除く）
同じように、製造メーカーそのものが、無くなりました。
メーカーはあっても、製造をやめてしまった所もあります。
現在、お宅に使用されているものが、これに該当する場合は、
そもそも、供給がなく、「不可能」としか言い様はありません。

詳しく現状を確認しなければ、なんとも言えませんが、
全面でなくとも一面だけと言うことも、可能な気もしますが、多かれ少なかれは、見栄えの違いは出るでしょうね。
「出隅」に同質出隅を使用していれば、そこに無理がくるでしょう。
デザイン、色の違い、厚みの違いによる段差、など。
金属などでの出隅を使用していても、厚い方の板材は、収まりませんので、上に板金などでかぶせることになるでしょうか。

私個人的には、提案のやり方では、見てくれが悪い気がしますが、
どうしても、全面以外に納得されない。業者は当初のやり方以外は出来ない。
と言うことであれば、「出るところに出る」以外はないでしょうが、
まず、労と金額に見合うものは、帰らないと思います。

どこまで要求するか？どこまで、やれるか？
業者との相互のやりとりで、すり合わせるほか無いと思います。