騒音源と考えられる通気弁は２か所あると考えてよろしいですね。
一か所はお宅の屋上（８階相当）、もう一か所は６階屋上（７階相当）でことらの方は、部屋から見えると言う事ですね。

風の強い日に何処からか音がして、外の通気弁が揺れていればここが騒音源ではないかと思うのは当然ですね。
騒音計で測れないと言う事は、ここが音源ではないと思われます。
お宅のような音が聞こえるならば、６階の住人の方が気が付くはずです。
確認して下さい。

お宅の屋上の通気弁の振動・音がコンクリート躯体に伝わったのではないかと回答しましたが、それ以外に壁・天井の仕上げ材部分で増幅されている可能性があります。
他の方のところで発生していないと言う事はこの可能性が大きいですね。

工事を行う場合は、不具合が発生しないことが前提条件です。
通気弁の取り換え工事を行って、騒音発生という不具合が発生したわけですから、手直しは施工会社の責任です。
マンション管理会社・管理組合に話を上げて、通気口をもとの物に戻すなりの騒音対策を行ってもらってください。

その後の臭気対策は、通気弁への取り換えとは別工事となりますから、管理組合で決めることでしょう。

なお、通気弁を開閉云々とありますが、メーカーが対応しているのですか？
通気弁のメーカーや構造が不明ですが、素人が勝手にいじると、下の階の排水に影響が出る恐れがありますよ。