理事会の見解は、「配管工事の改修で漏水したらそのままにしておけ」というのと同じことになります。　

改修工事でトラブルが発生したら、通常は施工会社の責任ですから通常は無償で直してくれます。

「管理組合を通して」とアドヴァイスしましたが、あくまで筋を通しただけです。
管理組合は、振動音を我慢しろと強制する権限はありません。
通常は住民の立場に立ってくれるのですがね。
住民側の利益代表という、立場が分かっていませんね。

我慢せずに、直接工事会社に改善要求をしてください。
もとの通気口に戻す工事費はアフターサービスの範囲内です。

頑張って下さい。