本件の基礎工事で躯体を支える重要部位に関しては、施工者、設計者等の瑕疵担保責任が付与されます。
つまり施工者側は、10年間にわたり本件に関する不具合に責任が法的に伴います。
本件は、施工者がハウスメーカーなので承知していると思われますが、この主要構造部位に関する瑕疵担保責任をしっかりと意識して貰うように促すべきです。

また施工過程の写真を独自に撮っておくことをお勧めします。
不具合が生じた際は、責任追及の証拠となります。

もしやすると、相当に強硬なクレームだったのかな？と想像します。ウォータージェット迄やるのは、メーカーとしては異例ではないでしょうか。

技術屋の個人的な見解、つまり、色々と技術者によって意見の分かれるところではありますが、私は現状のままの方が、今後、不具合が発生する可能性が少ないように思います。間違いは間違いとして、終わった事なので、如何に今後発生するリスクが少ない(決して補修費用をケチる意味ではなく)方法があるかを考えた場合、現状の補修方法が適切と思います。技術的な理由はたくさんありますが、専門的すぎるので省きます。

小さな怪我(と、申し上げるとお気に召さないかとは思いますが)には出来るだけ相応の出来るだけ小さな治療が良い訳で、大げさな大手術をすると、むしろそちらの副作用が怖い、、、という事です。

一からリセットというのは、お気持ちは判るにせよ、おそらく、それを言い出した時点で、現場はフリーズし、結果、何も解決しないまま時間だけが過ぎていく、、、みたいな事になろうかと思いますので、あまり得策ではないでしょうね。