問題無いと思われます。
おそらく、指摘されている「隙間」というのは、基礎に塗られている「モルタル」の厚さに起因するものと考えられ、それによる問題は無いと考えられます。

今は基礎の上に木の土台を乗せる際に基礎パッキンという硬質ゴムのブロックを挟みます。こちらで床下の通気をとるので基礎巾木の化粧モルタルを塗る際にモルタルがそこを塞がないように水切り下が定規になっている製品を使用しているようです。が、3枚目の写真を見ると、その定規の幅が違うものが組み合わされているようです。基礎巾木が塗装になっているので下地や塗料で通気パッキンが塞がれていなくて、かつ、基礎パッキンロングなどで防鼠対応されていれば問題ないかとおもいます。