土台水切り、透湿防水シート、スターター金物の施工方法ですが、

水切りの上に → 透湿防水シート → そしてその上からスターター金物。
だと思ってましたが我が家は、

水切り → スターター金物 → 透湿防水シート。の順で施工されてます。

メーカーの施工マニュアルを見ながら順番が違うのではないかと聞いたところ、『うちはこの方法でやってます。スターター金物のビスも隠せるし、水は金物の下の穴から抜けるようになってるのでこれで問題ない、JIOの検査も通ってる、メーカーのやり方よりより良い方でやってます』的な感じで、結局このまま進んでしまいました。

たしかに防水シートがスターター金物の上にあればビス穴からの雨水はふさげるから良いのかとも思いますが、何かデメリットはありますか？

『メーカーのやり方がいいなら、うちのやり方が嫌ならやり直しますけど！』と怒り気味で言われましたが。外壁半分くらい終わってるから、特に問題ないならこのまま進めた方がいいかと思ってます。

この方が良い施工なのでしょうか？
外壁屋さんも理にかなってるから殆どこれでやってますと言ってました。

どなたかメリットデメリット、JIO通ってるなら大丈夫等教えていただけると幸いです。よろしくお願いいたします。