こんにちわ！
継ぎ手が２か所あるという事ですが、
・１か所目ベタ基礎と立ち上がりの継ぎ手
・２か所目立ち上がりと天端の数ミリ
ではないでしょか？
それでしたら問題ありません。
１か所目ですが、ベタ基礎と立ち上がり2回に分けて打つ場合が多いかと思います。
その際に必ず出来てしまう場所になります。
鉄筋を入れているので、安心してよいかと思います。

２か所目についてですが、基礎天のフリク(デコボコ)の調整のために専用のセメントを流して、平らにする為のものなので、継ぎ手に見えているのかもしれませんね。
これに関しては土台を平らに設置するための役割と考えて頂けると分かりやすいかと思います。
写真が無いので、正解かどうかはわかりかねますが、恐らくこの2か所の事かと思いコメントさせていただきました。