>ウォーターハンマー現象だとしたら寒い時期しかならないのが不可解です。
>気温が低くなると（11月〜5月の10℃以下くらいの気温）

私が推測するのは、暖房がボイラーなどにより温水・不凍液などを循環するタイプではありませんか？
で、あれば 当然のこと温度により「「配管部材」は伸び縮みします。
配管が伸び縮みすれば、当然のこととしてそれの固定された周辺に多かれ少なかれの負担をかけます。固定したステーと擦れ合う。とか、短い時には触らない部分に伸びたために触るようになり、動くたびにぶつかる感じで音が出る・・・。
とかですかね？
広義に言うと確かにウオーターハンマーではあります。

配管の経路がどうなっているか？調べる必要があるかもしれません。
あなたの住戸の床下に、あなたの家の配管が走っている。あるいは、あなたの住戸の天井には、上階の方の配管が走っている。
それにより考え方は変わると思います。
いずれにしても、マンションであれば個人で対応するには限界があるのではないでしょうか？マンションの「管理組合｝？などとの相談事だろうと思われます。
かろうじて、床下に（下階の天井裏ではなく）配管経路があるのであれば、住戸の中だけで完結する可能性が無いわけはないということでしょう。