問題はないと推察されます。
木材は、現場に搬入されるまえにも木材置き場、搬入時など雨に晒されているのが殆どです。
殆どが施工中に乾燥してしまうものです。

万一、本雨さらしが後日になって躯体腐食の要因になった場合は、瑕疵担保責任の法的責任を施工者に問う事が出来ます。
施工者とは友好的な関係構築が必要です。
この瑕疵責任の件も含め、さり気ない指摘を行う事が賢い施主と云えると思います。