巾木とクロスの間のコークが太いですね。何らかの不得しないといけない理由があったのでしょう。通常木巾木ですと、木巾木の後にクロスを施工しますので、巾木の際でクロスをカットしているのはあってます。ただ、コークが太くなっているのは何らかの理由で巾木を後からつけたのかも知れません。それによって不陸が生まれグラグラしているのであれば下のボードから張り替えないと直らないかも知れないので、「ある程度仕方がない」となるかも知れませんね。

リフォーム時にどういった工事をしたかによると思います。例えば極端な話、「壁クロスは張り替えなくていいけど床は張り替えしたい」なんてなるとクロスはそのままで巾木は交換するっていう状況が考えられます。そうすると、こうなると思います。

２枚目のお写真は、納まりが悪いという問題ですね。巾木を撤去、床を上貼りした上で、新しく巾木をつける。という工事を想定すると、たぶん昔は無垢材の巾木で綺麗に納まっていたが、新しいのはキャップ止めにしたためにうまく付かない。納まりを考えていないのでもっと綺麗に納まる様考えないといけません。例えば、コーナーキャップじゃなくて、端部キャップなどで納めればうまく止まる様な気がします。もしくは巾木自体で留にします。大工さんに聞いてみてください。