お写真３枚の傷や隙間、おそらくフローリングを張った大工さんは木巾木がつくと思ったのだと思います。そうすると巾木に６〜７ミリほど厚みがありますから隠れます。ただ結果、ソフト巾木で厚みがなかったので見えてしまった。傷は補修で直りますが、隙間はフローリングを貼り替える必要がありますね。巾木を一度取る必要があるのと、小さく細いフローリングを貼ることになるので技術が必要です。そう言った細い材料が入らないように考えて最初の張り出し位置を考えればこんなことにはなりませんが、各部屋の間に敷居を入れずにつながっていたり、寸法が半端なマンションではよく起きがちですね。

床の水平は、見積内容によると思うのですが、カーペットを剥がすと大体水平は悪いです。カーペットは多少の凸凹は吸収しちゃいますから。その水平を直す費用までみてたかどうかですね。見てなければ必要最低限のついで工事しかしないでしょう。床下時にもよりますが文章の通り起き床などの床下地が組んであったら、水平を直すにはかなり広範囲で剥がしてやり直す必要がありますし、躯体に直張りなら佐官工事で水平を直します。異音もしていたとのことなので前者ですかね。柱だけ取り替えたって表現がちょっと。。柱とその上の下地合板まで取り替えないと水平直せないと思うんですが、柱だけってなるとその凹んだ部分を少し上げるために１、２本だけ上げたって程度に感じます。

施工不良というか、やり方と程度の問題と思います。お金と手間をかければその「精度」はどんどん上がりますが、どの程度までのクオリティを求めるかの事前の確認がお互いによくされていなかったように思います。