軸組み＋パネル工法との記述ですが、一般的なパネル工法とは、土台の上に建った柱、柱を繋ぐ桁の中に、断熱材を隙間なく挟む、パネル挿入工法の事を云います。本件でパネルと称している部材は、構造用合板だと思われます。
質問者が通常だと云われる順序は、グラスウール断熱材などの内断熱の手法です。

合板を柱の外側に打ち付けて、耐力壁倍率を高める効果があり、昨今では、筋交いから合板を用いる方法に変わりつつあります。
本件はその方法を用いているようです。

つまり、断熱材が合板の外側に断点なく（内断熱は柱で断熱材が途切れる）
施工できるメリットがあります。決して間違ったやり方ではありません。
施工が始まったばかりのようですが、疑問があったら、とことん納得できるまで担当者に尋ね、どうぞ100％、HMを信頼して良い家づくりを楽しみましょう。
楽しめない状況の時は、いつでも質問してください。

パネル＝合板の事であれば、福地さんのおっしゃている通りなのですが、

ご質問を拝読し、

＞通常のやり方では、断熱材が入らないので、サイディング（壁の構造の順番を変更する）狭地のため

＞断熱材（発泡系）

のあたりから推察すると、いわゆる、発泡系断熱材を注入したパネル（厚さ10ｃｍくらい）か、単なる合板に現場発泡ウレタン吹き付け、、、なのかな？とも読み取れます。

差し支えなければ、もう少し。正確に判るよう仕様をご説明いただけますか？