クラビア様のご回答に関連して補足します。
上下振り分けプランは工務店側からの提案です。狭い間口の奥にある縦長の土地なので「二軒の住宅を渡り廊下でつなぐプラン」を希望したところ法律上不可能だとされ、更に建設コストを下げるため総二階にして水回りを集めるよう提案されました。二階のトイレからの排水は、階下で聞くとバケツをひっくり返したような騒音になり、寝室に至っては階下で寝る父のいびきがうるさく感じられたほどです。
電気代4万円は二世帯で住み始める前、両親と私だけで住んでいた時の実績です。オール電化ではなくコンロ・給湯設備はガスです。
壁の断熱材の厚さは実家に帰って資料を見てみないとわかりません。
窓は樹脂ではなく、金属製のペアガラスサッシです。
また、ここで触れた開口部というのは階段とリビングの間の壁に設けた採光窓および階段からリビングへの入口です。全館換気システムの効率アップのために屋内の仕切りを極力なくし通気をよくするよう指示されたためで、ガラスや扉は入れてもらえず当初は枠だけでした。しかし夏は冷気、冬は暖気が階段から一階に流れ出てしまうことがわかり、結局ガラスをはめたり扉を設置（自費）して塞ぎました。
集中換気システムは上下１台ずつ24時間運転され、各部屋の壁に外気取込用のパッコンが設置されています。一部の部屋の床にも吸気用の開口部があります。換気システムは熱交換タイプかどうかわかりません。
私が楽器をたしなむので簡易防音の部屋を設けたのですが、あろうことかここが一番騒音がひどく、隣室の話し声がそのまま聞こえるという有様です。床の開口部が音漏れの主因らしいのですが、換気の関係上そこを塞ぐことはできないそうです。
おっしゃる通りいずれ一世帯で住む時が来るでしょうが、それまでの借家暮らしにかかる費用は家計からの持出しとなり生活を著しく圧迫します。また、もともと二世帯住宅ですから一世帯で住むには広すぎますし（現在も両親だけが生活）維持費もばかになりません。
福地脩悦様のご回答に関連して補足します。
工務店からは「冬暖かく夏涼しい、静かな家」を強調され、メーカーのパンフレットも同様のアピールばかりで「気密性能を上げれば屋内の反響音が大きくなる」ことなど一切触れられませんでした。こちらは素人ですから説明を素直に受け止めることしかできません。また、最初に上下の音漏れを指摘した際に工務店は「まだ家具が少ないため」と回答しましたが、二世帯用の家具を総て搬入してからも音漏れは低減しませんでした。素材までの提案はなかったので吸音性の高いものは入れておりません。グラスウールは使用されていないはずです。
エアコンは当初、工務店やメーカーの指示により全６台を24時間運転させました。その結果が４万円超／月の電気代です。エアコン使用を２台に制限したところ電気代は半減しましたが、部屋ごとに温度のムラができて快適性は失われました。
家の正確な床面積は実家に帰って資料を見ないとわかりませんが60坪程度であったかと思います。断熱材仕様も同様に、手元に資料がありません。
確かに感情的になっておりますが、3000万円を軽く超える「希望と逆行した」建物を掴まされ、しかも騒音が原因で妻が体調を崩したために二世帯を解消したこともあって、感情的になるのも仕方のないこととご理解ください。
竹沢正弘様のご回答に関連して補足します。
確かに外からの音の侵入は少ないですが、そもそも田舎なので内対外の騒音対策はそもそも必要ありません。私が工務店に求めたのは「他の部屋の音を気にすることなく静かに生活できる」ことだけで、その希望に対し工務店が胸を張って提案したのがこの工法であって、決して私自身は二兎を追っておりません。工務店の勉強不足と私の猜疑心不足が招いた悲劇とでも言いましょうか。よって、全く「言いがかり」ではありません。
「FP」や「ウレタンをパネル化した工法」というのは素人ですのでわかりかねますが、最初から特性さえ提示していれば工法自体は後ろ指を差されるものではないでしょうし、しっかり施工されているとも言えるでしょう。しかし、私が絶対に欲しくなかった家であることは確かです。

　これが本当に最後の質問です。
　別記の通り工務店は、１階の天井と２階の床全面を無料で重ね貼りしましたが、そもそも裏付けのない思いつきの対策ですから、期待した遮音効果は全くありませんでした（むしろ見た目の悪化や圧迫感で迷惑）。
　それでも工務店は、これで十分誠意を見せたとでも思っているのか、問題の幕引きを図ろうとしています。
　私側からすれば問題はひとつも解決しておりませんが、「結果はどうあれ」工務店の誠意を評価し、これ以上の要求は差し控えるべきなのでしょうか。
　もちろん私は、希望通りの家になるまで納得できません（持ち運びできる物であれば、金額に関わらずとっくに返品・返金させているところです）。
　感情論ではなく、一般論でご意見頂けますと幸甚に存じます。

　前回で最後と言いながら、どうしても専門家の方々のご意見を仰ぎたく、恥を承知で再度質問させていただきます。

　実は、私の考えている解決策のひとつに「増築」があります。
　二階部分にトイレ付きの（あわよくば風呂も付いた）部屋をひとつ建て増すことにより、多くの問題は解決できるものと考えております。

　但し、現在ある建物が総二階ですので、増築部分は宙に張り出す形になってしまいます。
　費用の面では見当もつきません。

　この構想の注意点や問題点など、お気づきのことがございましたらどうかご教授願います。

　再度のご回答誠に有難うございます。また、お礼のコメントが遅くなりましたこと心よりお詫び申し上げます。

　クラビア様も音のトラブルに遭遇された経験がおありのようですね。また、この工法についてよくご存知のようで大変心強く感じております。

　また、遮熱と防音を関係づけて分かり易くご説明いただき有難うございます。

　実を申しますと、実家（問題の物件）は同工法PRのための完成内覧会を行う目的があったので、建築にあたってはメーカー担当者の指導によりメーカー標準仕様の機器・材料が使用されております。にも拘らずこれほど住み心地が悪いのですから、工務店もさることながら工法自体の欠陥だと私は思っております。よって、最終的にはメーカーを含めて対処方法を検討していくつもりです。その際には、クラビア様のご意見も存分に活用させていただくつもりです。

　頂戴したご意見の中で、特に音楽室について触れさせていただきます。
　具体的に申しますと、４面ある壁のうち遮音できていないのはパッコン（排気レジスターというのでしょうか？）のある１面だけなので、やはりこの口から音が漏れているようです。クラビア様のおっしゃるような自然給気口らしきものが見当たらないので何とも言えませんが、可能であればここを塞ぎ、熱交換機が付加された同時給排型の換気扇の接地を提案していきたいと思います。

　そもそも私は、全館換気システム（第三種換気というのでしょうか？）自体に疑問を抱いておりましたのでクラビア様のご提案はこれを見直すいいヒントになりました。このシステムは音への影響もさることながら、全館に異常な乾燥をもたらすため冬場は慢性的な喉の痛みと風邪に泣かされておりました。風呂場の湿気を除くためシステムを停止できなかったのですが、音楽室同様に独立した換気扇を設置して対応できないかどうか提案していきたいと思います。

竹沢正弘様

承知致しました。
極力感情的にならぬよう、業者とは建設的な話合いを進めて参りたいと思います。