まず、マンション用直張りフローリングとは言っても、L45仕様ですと、ほとんどが裏側にスポンジ状の吸音、緩衝材が裏打ちされています。歩くと「フワフワ感」が間違いなくあります。また、その商品によっては部分的にフワフワのきついところと、そうでもないところが、規則的に感じる商品があります。まずは、そのせいでは無いでしょうか？ご確認願います。

既存床のボンドが残っていたとしても、ほとんどの場合、裏打ちされたクッション材により、それほど違和感を感じるとは、正直想像できませんし、現実的な話、わざわざ、元のボンドを違和感を感じるほど残しておくと、新しく貼るフローリングのノリをこすり付けるのに、邪魔でしょうがありません。仮に、「手抜き」としても、そんなメンドクサイ手の抜き方？をするとは考え難いのです・・・・・。

マンションの場合、新築時に和室や水廻りだった部分の床スラブは、かなり「水平」がいい加減だったりします。新築時に、直張りが前提で無いので、コンクリート面をコテで仕上げる手間を省いたりします。その部分に後から、フローリングなどを直張りすると、モロに高低さが足裏に伝わります。

では、リフォーム時に、その高低差を削り取るなどして、水平にすればいいじゃないか！と思われるかもしれませんが、マンションリフォームでは、いたずらに躯体を触る事ができませんし、削る場合、かなりの音がしますので、階下のお宅にご迷惑をおかけします。(管理規則で禁止されているのが普通です）そのあたりを勘案して、泣く泣く手をつけない（水平じゃないのを承知の上で。。）場合もあります。仕上がりは、全体に波打ったようになります。

端的にお答えすると
＞・昔のフローリングを剥がした後のボンドはそのままで、その上に施工するのが普通なのか？

普通ではありません。

＞・ボンドを残したままと私は思っていますが、第三者がフローリングを剥がさずにそれを確認する方法はあるのか？

赤外線サーモなど使えば、可能かもしれません。インスペクション会社にお問い合わせ下さい。

と、、、なるのですが、どうも、、前段で申し上げたような、原因だと思います。最初から「疑惑の眼差し」では無く、普通に施工業者にそのあたりの事をお問い合わせいただきたいと思います。「悪意」をもって行うには、手間がかかりすぎますので、きっと私が申し上げているような理由だと思いますよ。