あまりにもダイナミックなジャンカで少し唖然としています。
コンクリートの打設時にある程度のジャンカは気にしなくとも良いものですが、本件はその限界を超えているようにも思います。

ポリマーモルタルでの補修が一般的ですが気になるのは、ジャンカ状態の下部で、かぶり厚さの確保と鉄筋露出の状態です。
相当に行き届いた補修工事が伴うように感じます。

本件は瑕疵担保履行法と云う法律の対象工事です。
今後、このジャンカが要因で様々な事象が発生した場合の責任は、施工業者が負うことを法律で義務化となっております。
したがってハウスメーカーも安易な対応はできません。
この法律のことはハウスメーカーも充分に承知しています。

ともかくこのジャンカが今後において建物全体に影響を及ぼすことの無いよう、ハウスメーカーの確証を得るべきです。
ハウスメーカーが責任をとれないと判断した場合は、撤去して遣り直しを行う場合も在り得るかと思います。

福地さんのおっしゃる通り、ジャンカと言うにはあまりにもダイナミックすぎますね。。

で、状況確認なのですが、この面だけですか？それとも、外部に面する他の3面も同じでしょうか？また、室内側の布基礎（ベタ基礎であれば立ち上が）はどのようになっていますか？

ジャンカと一般的に呼ばれるのは、コンクリート打設時のバイブレーターのかけ方ですとか、水分量（W/C、水セメント比）、スランプなどのコンクリートの性質によるものに起因します。

であれば、基礎全体にこのような事象があっておかしくないのですが、この面だけとなると、コンクリートの性質や、打設方法によるものでは無く、「型枠」に何か問題があったのかな？とも推察されます。

そのあたりの情報も頂ければ、嬉しいです

型枠の「ふくみ」とは何をおっしゃっているのか判りませんが、あくまでも推論としてお読みください。

画像を拝見すると、あきらかに、あるラインから下だけのコンクリート表面が硬化不良を起こしています。上の部分と比べると一種異様な感じさえ受けます。

合板型枠は、現場で何度か使い回しをします。どこか違う現場で一度二度使用した型枠を使っても、それは普通の事なので、目くじら立てる事では無いのですが、例えば、それを保管している最中に、そうですね、、近所の子供がその上にコーラをこぼした、、あるいはかけた・・・で、乾いてしまってから、そうとは知らず、その型枠を業者さんが悪意無く、使った。。。
実は、コンクリート、、砂糖（糖分）に触れると硬化不良（固まらない）を起こします。
業者さんも、気を使って、上の方には新品の型枠、土の中に隠れる下の方には古い型枠（つまり、、コーラのこぼれた、、、）を使った。

そんな状況が成り立つとすれば、拝見する現象と合致します。

私も、糖分のついた型枠を使用した硬化不良、、という現象を見ておりませんので、断言はできませんが、そんなストーリーでも考えないと、ちょっと納得しにくい現象ですね。。


できれば、硬化不良を起こしている部分をコア抜き（丸くくり抜く）して貰って、圧縮試験をやって貰って下さい。打設終了後７日以上経過していれば、最終強度を推測できますので、まずは、それをやって貰ってください。

それなりの強度が出ていれば、先程のストーリー通りだったとしても表面だけで被害は済んでいますので、基礎の強度としてはモルタル補修でよろしいかな？と思います。
ただ、塗ったモルタルが剥離するのが嫌なので、念のため一度、糖分が残らないよう表面を洗浄して貰う事。仕上げとして、弾性系（伸び縮みする）の塗装をしていただいたら如何でしょうか？


もしも期待する強度が得られないのであれば、、そうですねぇ、、壊して作り直すよりは、今の基礎立ち上がりの外側に、もう一周、同じような基礎立ち上がりを作って、それを外壁ラインとする、、、つまり、現在の立ち上がりは見限って、一回り大きく作る。。
そんなやり方だと、それほどコストはかかりませんので、ハウスメーカーさんも受け入れやすいかもしれません。

不謹慎とお叱り受けるかもしれませんが、興味深く珍しい事例と思います。

内部の分の基礎が大変きれいに見えます。
外部の問題の分も、もしかしたら、ですが。

　２段に打設し、２段目の打設の時に、１段目との間で型枠に隙間があり、ノロが流れたものということはありませんでしょうか？
　そのように見えないことはないのですが？

　であれば、本物の「ジャンカ」部分は、少ないように感じます。

　この状況が、私が思うような状況なのであれば・・・・・ですが。

　本当に？ジャンカである部分の状況如何ですが、ノロの流れた部分の「問題点」は、美観でしか、ありません。
　お客様・・・という立場で言えば、その「美観」が限りなく大きい物だと言うことは、理解出来ないわけではありません。
が、強度的、耐久性、等　問題はありません。さらに言えば、「一手間」かけて、表面のはつり（ノロの除去）モルタル補修で、美観的には、問題無いと思われます。ましてや、土の中に埋もれる分には、問題外と思われます。
　
　層変わりの変色は、打設時が異なれば、当然、見てくれ的には違います。
意図して、配合を変えていたとすれば（可能性として）、当たり前に変わります。
　
　ジャンカ・・・・として、ジャンカの補修以外の部分は、「取り壊し」の必要性は無いのではないでしょうか？
　補修は、「ジャンカ」であれば、他の方々が（今回以外にも、過去の回答などでも）適切な回答を寄せてくださっています。私の感じた、「ノロの流れ」であれば、先に言った、「ノロの除去・モルタル補修」以上の、必要は無いと思っています。おそらく施工業者もそれ以上を要求しても、納得はしないでしょう。
　基礎業者の話は、全く信じていませんでした。などと、「不信感の固まり」にならないでいただきたいと、切に願います。

1.コアを水平にくり抜くとして、供試体は、3箇所必要になるのでしょうか

　その際、くり抜いた部分は、無収縮モルタルが良いのでしょうか。


この類の、調査は、何か基準があってその通りにしなければならない、、というものでは無いです。あくまでも「適宜」です
モルタルで構いません




2.角側にジャンカがあります。（写真添付）

　コンクリート打設の2層目が、ほとんど硬化不良だと思います。

　角側で、荷重が一番掛かる所がこのような状態です。

　21kN/?あれば、補修だけで問題ないとおもうのですが・・・

　なければ、栃木様の言われた対応も視野に入れています。

また、HMは、撤去でも構わないと言っています。


いろいろと技術的に「疑心暗鬼」が「誤解」になっているようで、、
角が一番力がかかる所でもありませんし、お写真拝見する限り、「ほとんど硬化不良」でもなさそうですね。

コア抜きして、１０〜１５　kNもあれば十分と思います


どうも、技術的な適否を云々してても、多分、「全面的な相互の信頼」を得るのは至難かと想像します。メーカーさんも、そのあたりを、総合的に判断し、あなた様の信頼を得るため、「撤去でも構わない」という事と思います。

そこまで、おっしゃっていただけるメーカーさんは、たいへん誠意的で信頼に足ると思います。

あまり、微に入り細に入り、技術的なお話に、固執せず、「気持ち悪いよね、だから、ちゃんとしようよ。。」という事で宜しいのでは無いでしょうか？決して「悪意」をもってこうなってしまった、、という事では無いと思いますよ。

技術的に何がどうあれ、「やり直し」というのが、総合的に判断して、双方、合点のいく解決策なのかな？という気がしてきました。無論、やり直すのであれば、コア抜きは不要です。