このヒビが、いったいどこまでの深さか？それが、どのように成長していくか？結果、そのヒビは「致命的な物」か？表面の塗装のヒビにすぎないのか？・・・・写真では判断に苦しみます。

　メーカーを呼んで対応を相談する予定であれば、その辺の不安を良く理解してもらう事は必要でしょう。納得いく説明がほしい。ということですね。
　心配が晴れない？なら、一筆もらっておければ、安心出来るでしょう。

　昔？のユニットバスは、完成品あるいは半完成品）を納品して、現場での作業は、あまりなかったものが多かったのですが、最近のものは現場組立で十分な精度と性能を保持できるようです。
　おそらく、ルイルイさんの住宅も、現場組立だと思います。
順番的に、床が一番最初に据えられ、壁が建ち、天井が乗る。ということで、ほぼ、全て解体後の組立になりますが、交換は不可能ではありません。

　メーカーがヒビを、どう判断するか？
　同じく、どう対応するか？どこまで対応するか？だと思います。
　

>工務店はこの工事（ユニットと洗面入れ替え、バリアフリー工事）の時に、いくつか間違いがあり、こちらが指摘するまで隠していました。指摘後は１か所を除き、直してくれました。ですが、この経緯があるから余計不安なのかもしれません。

　
　施工業者との経緯は、この際、実質的には、関係はあまりないと思います。
この件には、一応、フォーマットして最初からの方が良いのではないでしょうか？

>メーカーが「致命的でない」と判断した場合、私の意見と違うわけですが、公平な判断を下せる第三者機関的なものは存在するのでしょうか？
>有料でも構いません。ご存知でしたら教えて下さい。

　意見と違う・・・事は致し方はないのですが、
お客様の立場で、「不安」ということと、実情とはもちろん違います。
メーカーが、あえて悪意がある。というのでなければ、あくまで「不安」は不安でしかありません。
　「杞憂」にまで、納得するまでの説明責任は要求されないと思いますよ。

　第三者の判断を仰ぐことは、もちろん否定しません。が、そこまで、要りますかね？
　私なら、「何かあったら、メーカーの責任で、直してね！」の一筆でＯＫだと思います。
　
　お近くの「建築士会」、ホームインスペクターなどが、その第三者になると思いますが、費用は、様々ですし、まず、相談してみることだと思います。
　

　気持ちを「逆なで」しそうな気もしますが、
問題の「亀裂」・・・私には「亀裂」・・・・致命的な傷。なのか？「表面材（塗装膜）のヒビ」・・・あくまで表面のみの傷なのか？判断がつきません。

>最初の方とは別の２名がメーカーから来て、これは亀裂ではないと言い始めました。
>しかし、一度はあると言いきったのに、本当に腹が立ちます。

　私の思うに、この辺のお互いの認識の違いだと思われます。
ヒビとしては、存在する。しかし、（致命的な）亀裂ではない。という主張だと思われます。もちろん、「お客様」とすれば、「きず」はあくまで「きず」・・・大きくとも、小さくとも。なのは、十分理解はしますが、

>補修に掛かる費用を考えたら、ないとしてしまいたいメーカーの思惑も分からないわけではありません。

必ずしも、補修の負担を避けたい。・・・・逃げを打っている。
とは、言い切れない。と思います。
たかだか（メーカーにとっては）ヒビに、全部、壊してまでの修繕は、必要ない。と、判断していると思います。
　指の先に針を刺したら・・・・なめときゃ直ります。入院を希望しても、入院させる医者はいないでしょう。しかし、同じに見えても、毒虫に刺されたら？場合によっては、「大丈夫だから・・・」と言ったところで、入院させる処置もあり得ます。

　もちろん、「致命的ではない。」という、断定は、ここではできません。
担当者と、後々の対応を含めて、よく相談されることが、必要か？と存じます。