具体的に、どのような製品をどのように使っているのか？写真があれば、わかりやすいですね。
　単純に、「気密パッキン」、「隙間」というキーワードで、質問されれば、「問題ありません」とは、言うことはできません。
　それが、何かの誤解？か、表面上の隙間（に見える）か、可能性も否定できませんが。

　施工業者によく聞いてみてください。
はなっから「ミスだ！」という対応は、ＮＧで。もちろん、先方も「だまくらかそう」と、思っていなければ、問題無く話は進むと思いますよ。

　「ああ、少しあいたね。コーキングしとくよ！」とか、
　「ああ、これね。隙間に見えるけど、この奥でちゃんと塞がってるから。」など、安心出来る話にすすみませんかね？

　もし、引っかかりが、晴れなければ・・・・写真を添付していただければ、答えがしやすいと思います。もちろん、歓迎いたします。