すごい振動と音というのは，いわゆるウオーターハンマー現象かなと思います。
原理や原因は省略しますが，放置して良い場合とそうでない場合があります。
特に，ふみさんのお宅の場合，音が変わったという点が少し気になりました。
給水管のどこかがダメージを受けていなければ良いのですが。
トイレの件も含めて，給排水の専門家に見てもらう方がいいと思います。
ウォーターハンマー現象に対しては，その対策を取るための機器も市販されていますので，給排水の専門家に相談されると良いと思います。