一つ一つを見ると、褒められはしません。しかし、必ずしも、「重箱の隅」をつつく必要も無いかな？と思うのですが。

　無いにこしたことはない。レベルの問題です。
　
　どのようなお宅にも、「お客様」が来て、見せられない部屋、ありませんか？
　いくらなんでも、24時間「お化粧ばりばり」で、生活はしませんよね？
　墓場までといわなくとも、どのような方にも、言いたくない見せたくない「秘密」って、ありませんか？

　秘密だとは言いませんが、表に見えない部分にまで、見せる事を想定した施工は、「不必要」でしょう？
　決して、どうでも良い。というのではなく、「目くじら立てる」必要はない。でしょう？ということです。

　正直言って、一から十まで、そのようなものに、目くじら立てていては、
言う方も言われる方も「神経が擦り切れてしまいます」。
　目に入っても見えてない。・・・・・そんな対応が必要な部分もあります。

　決して、お気持ちを理解しないとか、
「建て主には一件だけ、施工側には、多数の中の一件」とか、言っているわけではありません。

　お気持ちを理解しないワケではありません。

　一枚目
　屋根板（野地合板）の釘ですが、まだ、屋根が施工される前であれば、「抜く」と言っても、なんの問題もありません。が、
　屋根が葺き上がった状態では、「不可能です」
屋根が葺かれる前には、にじんだり漏れたりした雨水は、屋根が葺き上がった時点で（通常は）もう来ません。
　さらに言えば、小屋裏になってしまい、見えません。

　二枚目・・・・（のつもり？）
　板状断熱材の施工だと思いますが、「褒められ」はしないでしょうが、「ダメだし」、「交換」などのレベルではないと、思われます。
　今から間に合うのなら、「ウレタンフォーム」を、吹いてもらえば、精神安定上は良いかもしれません。

　三枚目・・・・（私ではない？）
　外壁の裏のウレタン皮膜？ではないでしょうか？
これで終了・・・であれば、二枚目のように「ウレタン」処理でしょう。
おそらく、これにさらにグラスウール等による断熱がされませんか？
　それであれば、なんの問題もありません。この「めくれ」で、何かが起こることも、ほぼありません。

　四枚目から六枚目
　クロスの下地、あるいは他の仕上げの下地と推測します。
決して、きれいです。なんて言えませんが、この程度であれば、特に「出隅」とか、「幅の狭い部分」とかは、有り得ます。もちろん無いに超したことはありません。
　クロスと仮定すれば、パテ盛りにより、平滑にされ、見えなくなります。

　七枚目から九枚目
　釘が出ているのは、長い釘を使っているから・・・・・それだけ、お互いの部材の緊結が強くなるかな？ということでしょう。
　何度も言うように、見えない部分ですので、「釘が出ないように、短いものを打つ」といった、配慮は必要ない。効きと、見てくれを天秤にかけて、文句なし、効きを選んだ結果です。
　ここも、壁の中。見えなくなります。断熱材が入るのならば、なおさら、問題ありません。

　結果的に、「問題なし！」と、判断し、回答させていただきました。

大工さんを悪く言うつもりはありませんが、相当に雑な仕事ですね。一事が万事という言葉もありますし、これらの写真以外の部分も、想像できます。多分、創さんが、お気づきになっていない部分でも、かなりの部分が「困ったさん」状態なのかな？と思います。

一つ一つの事象だけ捉えると、竹澤さんのおっしゃる通り、補修可能であったり、「素人さんが目に付く部分」だったり、致命的な問題でないかもしれません。。が、、
総体的なレベルとして「第三者の目」があった方が、今後の「抑止力」にはなるのかな？と思います。

決して、「引渡し後」でなくとも、構いません。
現地を直接、目で確認できる専門的な第三者にお願いした方がいいかも、、、と、私も思います。

　蛇足モードで、すみません。

　今までは、見えない所の話でして、問題は無かった？のですが、
これからは（今現在？）見せるための施工が続きます。

　栃木さんの言う、
「一時が万事」モードの大工さんであれば、問題が表面化するのは、これからです。
十分に「目を光らせる」時が来ました。・・・・・なんて、煽ったら、いけませんね？
　神経が摺り減らない程度に、よく見てください。