お気持ちは理解しますが、
建て替えは、無理難題に近いと思います。

　現状を、確認いただき、
＊原因としての配管忘れは、解決している。
＊床下は乾燥している。(過去はともかく・・・・・）
＊消毒液が撒かれた後、カビは見えない。
＊床下換気口は十分に有り、乾燥が維持されている。

　これらが、問題無い状況であれば、問題は無い？と思われます。
くれぐれも、最後の「換気をして、乾燥が維持される」状態に配慮ください。
発見までの期間を考慮すると、乾燥が継続する。限り「カビ」の再発は心配ありませんし、「泣き寝入り」の必要も無いと思いますよ。

　交渉事・・・・の件ですが、
今後の動静如何によって、どうのように、対応してくれるのか？
を、確認、約束しておくことで、良いのではないでしょうか？
24日の間の「ペナルティー」の部分は、ご自由にお考えください。
第三者が介入する事ではない？と思います。