質問のご主旨（どのような状況なのか？）が不明ですし、「実は、、」的に、但し書きがあるような気がしますが、、、

「窓を増やす」だけであれば
床面積が増えていませんので、建築基準法上の増築ではありません。

「窓を増やす」だけであれば
建物をいじるのですから「改築」にはなりますが、「抵触」という言葉を使われているので、、、、「基準法上、確認申請が必要な行為」ではありません。

何か、その他の行為と同時に行う「窓を増やす」事であれば、そもそもの行為によります。

どうも、前回のご質問と関係ありそうですね。。(^_^;)

約款内容に関しては何とも言いようがありませんが。。。

注意深く読んで頂きたいのですが、、、、
建物をいじる、、という、一般概念では「改築」ですが、
少なくとも「確認申請が必要な行為では無い事」
それと、「建物をいじる事」＝「改築」という解釈であれば、
室内のクロスを貼り換えるのは改築なのか？
換気扇を修理する事は改築なのか？という論議になります。

構造的、合理的に考えて、「不同沈下」と「窓の増設」の因果関係は無いように思います。

一度、余計な事は何も言わず、「約款上の＜改築＞の定義」は何なのか？を、交渉前に証拠に残る形で（メールでも良いと思います）、問い合わせし、言質を取っておくのも一案かもしれませんね。