「耐震診断」とは、基本、中古住宅に行うものです。
ですから、新築で購入された場合は、手続き上は確認申請によって（正確には4号特例と言って、設計者の責任において）その合法性が担保されるという建てつけになっています。

スジカイについては、「面材」と言って、違う形式の方法もあり得ますので、図面を拝見しないと何とも申し上げられません。

許容地耐力20ｋN　と書いている場合は、地盤改良など行わない場合を想定しての書き込みですので、地盤改良されていなくても、不思議ではありません。

「保証付き」が何の「保証」なのか判りかねます。

お話しが断片的で、全体像がつかめないのですが（無理からぬ事とは思います）、私の方で、建物も拝見せずにお答えするのには限界があります。

建物の安全に関して、全然、問題の無さそうなお話しから、突然、出てきた、「床と壁の隙間」なんてのは、基礎のお話しなんかよりは、ちょっと、嫌な印象を受けます。

まずは、お近くのホームインスペクターさん　http://www.jshi.org/search/　か、お知り合いの建築士さん（できれば、現況検査などに手慣れた方）に、一度、トータルで、見て頂いては如何でしょう。ご夫婦で、妙に思い悩み、中途半端に、私どもにご相談されるより（私どもも、中途半端なお答えしかできません。全く、現物拝見せず、想像でお答えしていますので）、よほど、精神的に楽かと思いますよ。

もちろん費用は取られますが、その方が宜しいのでは？

幸いなことに、瑕疵保険に入っているようで、これは、10年間、住宅の構造耐力上主要な部分＆雨水の浸入を防止する部分については、対応可能ですし、何か、紛争が発生した時の相談窓口もあります。
http://www.kashihoken.or.jp/insurance/shinchiku/qa.php

売主さん若しくは施工者と交渉するにしろ、どのような状態で、これは、補修を要する工事である、、というのは、あなた様に証明義務があります。
その為にも、第三者の目が必要と思います。

まずは、検査し、その上で、何も無ければOK。何かあれば、対応いただけば宜しい。。。。

普通に、病気と同じですね。「これは良くない病気だろうか？」と一人で思い悩んでいても病気は治りません。検査して、病気でなければ、ラッキー。。（＾▽＾。病気であれば治療すれば宜しい。

個別の事象のお話は、多分、お聞きすればキリ無く出てくるのでしょう。まずは、トタールに客観的、合理的に判断できる方にご相談なさってください。