回答がつかないようなので・・・。
設計ミスとは言わないですが、細かい納まりに関しての問題かと思います。

例えば洗面台が設置されるスペースの幅を構造上多少のクリア（余裕）を持って設計をすれば、ボードを張ったりモルタルを塗ったりすることができます。コンクリートがはらんでしまうことを考慮するならばそのような設計をして施工精度をあげる工夫をします。その分限られたスペースの中での居住スペースは狭くなってしまいますが。どちらが正しいということは言えないと思います。

２枚目の写真のように壁から枠材が飛び出ている部分のことをチリと言いますが、チリを取るということはこういう場合に見た目をよくする手法です。例えば２mmの違いが出てしまう場合、チリが少ないと１〜３mmとその違いが目立ってしまいますが、チリを大きくとれば、８〜１０mmとその違いは目立たなくなってきます。既製品の建て具枠などは多いと１５mmほど枠のチリをとっています。デザイン性を重視する設計屋さんだと、チリが少ないほうがスッキリ見えるなどの理由でチリを押さえることは多々あります。

今から何か解決する方法としては具体的に思いつかないですが、ご健闘をお祈りします。